在一些腫瘤細胞中缺少端粒酶逆轉錄酶（TERT）會導致端粒酶的失活，說明TERT 的量和端粒酶活性存在平行關系，與此相似，端粒酶RNA組分（TERC）的量與端粒酶活性也有平行關系。
TERC的轉錄會被 Sp1 和 HIF-1 激活而被 Sp3 抑制，這在MAPK 的信號級聯通路與 TERC 啟動子的沉默中都能找到依據 。
而且，TERT 和 TERC 的轉錄似乎會受到表觀遺傳控制，如 H3 和 H4 乙酰化水平降低會抑制 TERC 的表達。
TERC 中至少有 6 個位點會受到假尿苷化修飾，有趣的是，這些位點中的兩個都位于一個對端粒酶催化活性非常重要的高度保守結構域。
利用假尿苷化 TERC 所做的端粒酶體外重構實驗表明在假尿苷化后端粒酶的活性和持續合成端粒能力都發生改變，這進一步說明在體內，TERC 的修飾可能會調控端粒酶活性，但是這還需要確切的證據來證明 。
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